风险分析和预警是美国食品安全制度的重要基石。其有效作用机制可以从下列“美国疯牛病案例”中得到见证。

2003年12月23日，美国农业部自从表示发现一头疯牛病疑似病例后，即对其展开调查，FDA也随即派出数个工作组，对相关产品尤其是最可能的传播途径——动物饲料进行追溯和跟踪调查。12月27日，初步调查结果显示，感染疯牛病的牛来自加拿大，在2001年，曾有74头奶牛从加拿大艾伯塔省运入美国爱达荷州的伊斯特波特，其中就包括这头病牛，后来该牛被运输到华盛顿州，并于12月9日被宰杀。随后的DNA监测验证了其来源。

受美国肉类出口协会委托，2004年6月15日美国动物科学组织肉类科学专家、美国科罗拉多州立大学教授凯斯•贝尔克在京接受中国新闻媒体的专访时谈到，自1980年后期以来，美国农业部便有一项疯牛病是否可能发生在美国的探讨计划。美国建立了一套专门用来检测疯牛病是否在美国存在的监测系统，事实证明这项系统已经奏效。2003年12月23日发现这头染病的乳牛、并了解到它出生加拿大、2001年进口到美国，得归功于这个监测系统。1998年，美国农业部委托“哈佛风险分析中心”评估“假设疯牛病在美国发生、为防止其向动物和人类传播、美国所采取的措施的有效性”。该风险分析中心为此建立概率仿真模型，预测可能被疯牛病感染的牛的头数、疾病持续的时间和人类遭受污染食物侵害的可能性。2001年11月，哈佛风险分析中心对疯牛病在牛群中传播和对人类的危害性又做了评估。评估所获的一项重要结论是，1997年FDA禁止使用动物饲料法规出台前出生的动物感染疯牛病的数量以及人类遭受污染食品侵害的可能性达到最高，但法律实施后会急剧下降，2020年疯牛病在美国将最终根除。